序号

核心服务模块

核心服务内容

精简技术指标

备注

1

样本处理与核酸质检

样本核对、高分子量核酸提取、全项质检

三代DNA：总量≥5μg，浓度≥50ng/μL，OD260/280=1.8-2.0，无降解无蛋白污染；二代DNA：总量≥2μg，质控合格；二代RNA：总量≥50ng，浓度>20ng/μL；出具正式质检报告

采购人提供冻存肌肉等组织样本，服务方负责提取质控，样本损坏全责

2

高通量测序与文库构建

二代Survey、三代Pacbio HiFi、Hi-C文库构建及测序，数据质控过滤

二代Survey：≥80Gb，Q30≥85%；三代Pacbio HiFi：≥30Gb，平均读长≥15kb，测序深度≥30×，无外源污染；Hi-C数据：≥100Gb，有效互作≥70%，测序深度≥100×，无外源污染；转录组RNA：≥10G

兼容PacBio平台，数据不合格免费重测

3

基因组评估与染色体水平组装

K-mer特征评估、三代组装、去冗余、Hi-C染色体挂载、优化、评估

K-mer精准评估基因组大小、杂合度；Contig N50≥1Mb，Scaffold N50≥10Mb，染色体挂载率≥90%；BUSCO（软体动物门）≥80%，无大面积gap，达染色体水平

拒绝草图组装，核心指标不达标无条件重拼

4

基因组注释评估

重复序列注释、基因预测、基因功能注释、非编码RNA注释

编码基因预测≥18000个，核心数据库注释率≥85%；出具论文级图表

贴合海洋贝类特性，成果经过充分分析和讨论，满足科研项目结题要求

5

全流程质控与成果交付

全程质控、数据溯源、污染检测；成果交付、科研保密与技术支持

污染率≤1%，全流程可溯源；交付原始数据、染色体级基因组、注释文件、分析报告；周期≤90天，全程保密答疑

协助数据上传公共数据库，不合格免费返工，支持1次格式调整