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福建省水产研究所关于采购“50k海带育种芯片”基因分型检测服务的招标公告

各服务供应商:

根据我所科研项目需要,现拟采购“50k海带育种芯片”基因分型检测服务,用于构建海带基因组育种参考群体及开展相关育种研究。现诚邀符合条件的供应商对本项目进行投标报价,具体事项通告如下:一、供应商资格要求

具有独立法人资格,持有有效的营业执照、税务登记证及相关经营许可。

具备提供基因芯片检测服务所需的专业技术能力和相关资质。

所投产品(或服务)须拥有自主知识产权或取得合法授权。

近三年内无重大违法记录及行业处罚记录(需提供声明或信用查询记录)。

供应商需具备与所提供服务相匹配的技术支持和数据分析能力,能提供技术人员资质证明。

二、技术指标与服务要求

(一)采购标的需满足的质量、技术规格等要求

1.海带重测序:基于华大平台完成350份样本基因组重测序及GWAS分析

要求

1.1基于磁珠法对350份海带样本进行DNA提取;

1.2采用琼脂糖凝胶电泳、NanoDrop检测,DNA样品无降解、无RNA污染、无蛋白污染,浓度≥2ng/μL,DNA总量≥200ng;

1.3每个样本测序下机数据量≥7Gb,350个测序下机数据总量≥2450Gb;

1.4每个样本下机数据平均质量Q30≥95%;

1.5质控后无AT、GC分离现象;

1.6对下机数据进行参考基因组比对、进行SNP及InDel检测及注释,提供gvcf文件。

1.7群体选择分析:包括群体碱基多样性分析、亚群体多样性比较、群体间遗传分化指数、杂合率选择消除分析、Tajima'sD分析、跨群体复合似然比检验、群体分化候选区域、群体受选择候选区域分析及对应的GO富集分析及KEGG富集分析等分析内容)

1.8全基因组关联分析:包括表型与基因型数据质控、主成分分析(PCA)、群体结构分析、进化树的构建、LD衰减分析、亲缘关系分析、GLM等不少于5种模型分析及对应的GO富集分析及KEGG富集分析

 

2.液相芯片开发:采用基于GBTS液相芯片技术开发的50k海带育种芯片,且须采用非Illumina测序平台进行检测。

要求

2.1芯片密度:芯片包含的有效SNP位点数不低于5万个(50K)。

2.2位点要求:

位点需在海带基因组上均匀分布,平均间隔小于50kb。

应包含与生长、叶宽、无边等重要经济性状相关的功能位点或候选基因位点。

应包含用于亲子鉴定和亲缘关系分析的SNP位点。

2.3检测质量:

※液相芯片位点平均检出率须达到99%以上,确保分型结果的准确性和稳定性。

样本检出率需大于98%。

2.4测序数据质量:

所有样本须满足要求测序量100%。

下机数据质控过滤后,平均碱基质量值超过Q20的reads应达到95%以上,超过Q30的reads应达到90%以上。

2.5分析内容:

提供基于SNP芯片数据的全基因组遗传变异分析。

能够用于进行和群体遗传结构分析。提供亲缘关系分析、家系构建、近交系数(ROH)评估及群体遗传多样性分析报告。

2.6数据交付:

提供所有检测样本的原始芯片数据文件(如FASTQ格式)和基因分型结果文件。

※数据返样周期:每1T数据在5个自然日以内完成交付。

提供完整的、详细的个体和群体水平的检测分析报告。

所有检测数据及评价报告等数据所有权归甲方(福建省水产研究所)所有。

 

3.芯片检测

(二)采购标的的数量、交付或者实施的时间和地点

计划采购数量:350份海带样本重测序及1份液相芯片开发。

※采购项目交付:合同生效后,根据采购方检测计划,供应商在收到样品后14个自然日以内(液相芯片检测周期)完成样品检测并交付全部数据和分析报告。

实施地点:供应商自建实验室。

(三)采购标的需满足的服务标准、期限、效率等要求

供应商须提供可扫码录入的采样装备(包括采血管、扫码设备、扫码小程序),实现样本信息的高效、准确录入,提升采样环节的数字化管理水平。

根据采购方采样计划,供应商在接到采购方通知后3天内须安排邮寄出采样耗材。

供应商在收到合格样品后14个自然日以内须完成样品检测并交付初步数据。全流程测序周期(含数据交付)不超过21个自然日。

(四)采购标的的验收标准

重测序数据量大于2450Gb

检测产品核心SNP位点数须大于5万个,且位点信息与投标文件一致。

检测产品须采用非Illumina测序平台,并提供基于GBTS液相芯片获得的原始数据及分型结果。

投标产品检测结果的位点平均检出率须高于99%,样本检出率大于98%。

下机数据质控过滤后,平均碱基质量值超过Q20的reads须达到95%以上,超过Q30的reads须达到90%以上。

数据分析报告内容需满足招标文件中的全部要求。

数据交付周期须满足每1T数据5个自然日以内的返样要求。

三、报价文件要求

本项目最高限价为10万元(人民币),报价超过最高限价的视为无效报价。报价应包含样本检测、数据分析、报告出具及税费等所有费用。

报价文件内容应包括:

1)按项目要求提供报价文件,并加盖单位公章;

2)附营业执照副本复印件;

3)附法人代表授权委托书原件、法人代表身份证复印件、委托代理人身份证复印件;

4)提供所投芯片产品的详细技术参数、知识产权证明或合法授权证明;

5)提供近三年内无重大违法记录声明函;

6)提供售后服务承诺函,明确数据交付周期、技术支持及质保服务。

上述资料均需加盖报价供应商单位公章,装订成一册后加盖骑缝章。将上述资料用信封密封,在信封封口处加盖公章。不满足上述要求的报价文件视为无效报价文件。

四、报价文件应于20267318:00前送至福建省水产研究所1号楼213(厦门市湖里区海山路7号),联系电话13599631860。逾期送达或者未送达指定地点的,不予受理。

 

注意事项:我单位将按照有效报价由低到高的顺序推选中标候选人。比选中选单位,如遇价格相同的实行抽签法决定。若出现第一中标候选人放弃中标的情况,我单位将按照中标候选人名单排序依次确定中标人。当提交响应文件的供应商或者实质性响应市场比选通告要求的供应商少于三家时,终止本次公开比价采购,择日重新招标。

 

附件:采购供应商资格承诺函

 

福建省水产研究所

2026626

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 


附件:

采购供应商资格承诺函

致:福建省水产研究所

  单位名称(自然人姓名):

  统一社会信用代码(身份证号码):

  法定代表人(负责人):

  联系地址和电话:

  我单位(本人)自愿参加本次采购活动,严格遵守《中华人民共和国政府采购法》及相关法律法规,坚守公开、公平公正和诚实信用等原则,依法诚信经营,并郑重承诺:

  一、我单位(本人)具备采购文件要求以及《中华人民共和国政府采购法》第二十二条规定的条件:

  1.具有独立承担民事责任的能力;

  2.具有良好的商业信誉和健全的财务会计制度;

  3.具有履行合同所必需的设备和专业技术能力;

  4.有依法缴纳税收和社会保障资金的良好纪录;

  5.参加政府采购活动前三年内,在经营活动中没有重大违法记录;

  6.法律、行政法规规定的其他条件。

  二、不存在违反《中华人民共和国政府采购法实施条例》第十八条规定的单位负责人为同一人或者存在直接控股、管理关系的不同供应商,不得参加同一合同项下的政府采购活动。除单一来源采购项目外,为采购项目提供整体设计、规范编制或者项目管理、监理、检测等服务的供应商,不得再参加该采购项目的其他采购活动情形。

我单位(本人)对本承诺函及所承诺事项的真实性、合法性及有效性负责,并已知晓如所作信用承诺不实,可能涉嫌《中华人民共和国政府采购法》第七十七条第一款第()项规定的提供虚假材料谋取中标成交违法情形。经调查属实的,愿意接受行政监管部门按照《中华人民共和国政府采购法》第七十七条:“处以采购金额千分之五以上千分之十以下的罚款,列入不良行为记录名单,在一至三年内禁止参加政府采购活动,有违法所得的,并处没收违法所得,情节严重的,由市场监管部门吊销营业执照,构成犯罪的,依法追究刑事责任和政府采购法律法规有关规定处理。

 

  供应商名称(单位公章):

  年      

  

:

  1.我单位(本人)专指参加采购活动的供应商(含自然人)

2.资格承诺的供应商应在报价文件中按此模板提供承诺函,否则,视为未按照比选通知书规定提交报价人的资格及资信文件,按资格审查不通过处理。