海域与海岛工程研究中心于2003年成立,主要从事涉海工程的海域使用论证、海洋规划、海洋水文调查与研究和海洋测绘等业务工作,旨在为我省海洋与渔业高质量发展提供技术服务,涉及港口码头、航道、铁路、公路、跨海大桥、海上风电、渔港工程、海底管道等领域,先后承担了漳汕高铁、福厦高铁、厦门新机场、福州机场、福清风电、湄洲湾航道等众多重大工程海域使用论证项目共400余项,福建省围填海生态评估和修复方案编制项目20余项,以及沿海市县养殖规划。