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2005年6月我所向福建省测绘局提交海洋测绘资质（乙级）申报材料，2005年8月，省测绘局对我所的测绘仪器设备、测绘档案管理、测绘工作业绩、测绘产品质量控制、人员素质和综合技术力量等6项指标进行了考核评定，经过近4个月的逐项考核，6项考核内容全部达标，于2005年底取得了海洋测绘资质证书（乙级）。该证书的取得，提高了我所的综合实力，增添了向海洋进军的能力，也为我所科技人员扩展了施展才华的空间。
据悉，福建省海洋与渔业系统中，原持有国家海洋局海域使用测量资质证书的单位，只有我所通过省测绘局考核并取得海洋测绘资质证书（乙级）。